Op bijna dezelfde hoogte als het kasteel van Riomaggiore ligt de kerk San Giovanni Battista. De kerk stamt uit 1340 en is gebouwd door de bisschop van Luni genaamd Antonio Fieschi. In 1870 heeft de kerk een verbouwing ondergaan en is daarmee vergroot. De enige overgebleven elementen van het originele kerkje zijn de gotische deuren die versierd zijn met figuren welke op mensen en dieren lijken. Bij de verbouwing kreeg de voorgevel een ander uiterlijk en werd het oorspronkelijke raam welke de vorm had van een roos vervangen.
San Giovanni Battista heeft van binnen drie beuken die door bogen gescheiden worden. In de kerk zijn een aantal kunstwerken te bewonderen zoals een Crucific van Maragliano en een drieluik van Antelami en de Prekende Doper.